Microscope à microdissection laser

Un microscope optique équipé d’un faisceau laser concentré pour découper et isoler un échantillon d’intérêt à l’échelle micrométrique.

Le microscope à microdissection laser permet l’obtention de microéchantillons dédiés à l’analyse du transcriptome à l’échelle cellulaire. Le PALM Microbeam emploie un faisceau laser concentré pour découper et isoler l’échantillon d’intérêt à l’échelle du micromètre. La catapulte laser permet ensuite d’isoler la zone cible rapidement et sans contamination. Les ARN des échantillons ainsi capturés peuvent ensuite être obtenus grâce à des protocoles spécifiques puis analysés par PCR quantitative ou RNAseq. D’autres applications sont envisageables : métabolomique , protéomique,  isolat de microorganismes, isolation de cellules uniques pour la génomique… toutefois ces applications n’ont pas encore été développées dans le laboratoire.

Etudes transcriptomiques de tissus infectés par un pathogène, de la symbiose mycorrhizienne, de processus physiologiques à l’échelle cellulaire, de tissus du bois…

Articles de référence :

• Hacquard et. al. 2010 Laser Capture Microdissection of Uredinia Formed by Melampsora larici-populina Revealed a Transcriptional Switch Between Biotrophy and Sporulation. MPMI 2010 23:10, 1275-1286
• Hacquard et al. 2013. Functional heterogeneity within ectomycorrhizas. Environ Microbiol, 15: 1853-1869.  https://doi.org/10.1111/1462-2920.12080
• Durand et a. 2020. Element content and expression of genes of interest in guard cells are connected to spatiotemporal variations in stomatal conductance. Plant, Cell & Environment 43 (1), 87-102

Contact

Christophe Rose : christophe.rose@inrae.fr

Pour aller plus loin

https://www.youtube.com/watch?v=Qs8onaLfq8c